Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC27P30260 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC27P30260 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC27P30260 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC27P30260 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC27P30260 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC27P30260 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC27P30260 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC27P30260 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC27P30260 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC27P30260 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC27P30260 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC27P30260 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC27P30260 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms