Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP11P24347 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP11P24347 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MMP11P24347 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP11P24347 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP11P24347 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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