Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRGP23470 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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