Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRCP23327 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRCP23327 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HRCP23327 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms