Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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