Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XBP1P17861 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
XBP1P17861 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XBP1P17861 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms