Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HOXB9P17482 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms