Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP2A2P16615 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms