Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2BP0DI82 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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