Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VIL1P09327 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VIL1P09327 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms