Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHOP08100 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOP08100 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms