Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms