Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POP4O95707 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POP4O95707 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms