Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms