Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH16O75452 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RDH16O75452 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RDH16O75452 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RDH16O75452 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RDH16O75452 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RDH16O75452 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RDH16O75452 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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