Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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