Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA1C9JL84 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms