Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RGPD3A6NKT7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RGPD3A6NKT7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms