Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A8A0AV02 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms