Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAP3K4Q9Y6R4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms