Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP15Q9Y4E8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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