Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms