Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms