Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PADI4Q9UM07 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PADI4Q9UM07 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms