Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms