Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASIC3Q9UHC3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms