Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms