Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms