Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX3Q9UBR4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms