Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms