Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGSF9Q9P2J2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms