Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX02

NLRP2, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP2Q9NX02 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLRP2Q9NX02 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLRP2Q9NX02 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms