Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms