Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CISHQ9NSE2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms