Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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