Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARHGEF3Q9NR81 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms