Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms