Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC2Q9BYS8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms