Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLJ22447-202ENST00000556569 1312 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms