Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SALL3Q9BXA9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms