Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms