Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LPIN3Q9BQK8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms