Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms