Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms