Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms