Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms