Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAT1Q99536 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms