Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDRT15Q96T59 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CDRT15Q96T59 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDRT15Q96T59 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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