Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms