Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC7Q96M83 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms